Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXB0

MKS1, Meckel syndrome type 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1Q9NXB0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MKS1Q9NXB0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MKS1Q9NXB0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms