Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWU1

OXSM, 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXSMQ9NWU1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OXSMQ9NWU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
OXSMQ9NWU1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
OXSMQ9NWU1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms