Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 ANKRD13D-213ENST00000512231 2768 ntTSL 213.65□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EIF4G1-227ENST00000455679 542 ntTSL 413.6□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 POLR3E-218ENST00000569787 727 ntTSL 313.6□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 REEP5-204ENST00000497856 1779 ntTSL 1 (best)13.58□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 GAK-220ENST00000513935 573 ntTSL 213.56□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.244e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NIPSNAP2-204ENST00000446692 662 ntTSL 413.43□□□□□ -0.264e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.284e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 LAMB1-212ENST00000479448 304 ntTSL 313.27□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.294e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 ZNF451-206ENST00000370711 609 ntTSL 413.16□□□□□ -0.31e-8■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 SPG7-207ENST00000563218 654 ntTSL 513.15□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 SCAF8-203ENST00000417268 4944 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.314e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.324e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-207ENST00000481797 5741 ntTSL 212.99□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FBLN1-203ENST00000340923 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 LAMB1-211ENST00000476039 653 ntTSL 212.63□□□□□ -0.394e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 PIP4K2B-203ENST00000617781 927 ntTSL 212.55□□□□□ -0.44e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 REEP5-206ENST00000511865 1187 ntTSL 212.31□□□□□ -0.444e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FKBP1A-207ENST00000474657 641 ntTSL 212.25□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FKBP1A-201ENST00000381715 705 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EIF4G1-214ENST00000427141 730 ntTSL 512.19□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CORO1C-201ENST00000261401 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.464e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 USP33-211ENST00000524536 949 ntTSL 312.14□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CEP85-202ENST00000451429 4061 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NAALADL1-217ENST00000532450 635 ntTSL 512.11□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DDB1-223ENST00000543658 571 ntTSL 412.11□□□□□ -0.474e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DPM1-202ENST00000371584 1073 ntTSL 512.1□□□□□ -0.478e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 LAMB1-204ENST00000393561 5766 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 GAK-218ENST00000511983 558 ntTSL 411.99□□□□□ -0.494e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EHMT1-228ENST00000636027 3114 ntTSL 511.88□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 RBBP9-203ENST00000493184 921 ntTSL 311.86□□□□□ -0.514e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NAALADL1-221ENST00000533842 495 ntTSL 311.79□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 COL4A5-201ENST00000328300 6483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 COL4A5-202ENST00000361603 6469 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NAALADL1-205ENST00000524445 622 ntTSL 511.26□□□□□ -0.614e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EIF4G1-220ENST00000440448 578 ntTSL 411.19□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 RIC8B-204ENST00000462949 3389 ntTSL 211.08□□□□□ -0.644e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-201ENST00000318967 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DDB1-221ENST00000543162 575 ntTSL 410.89□□□□□ -0.674e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 SSFA2-208ENST00000454579 3772 ntTSL 210.81□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 WDR91-201ENST00000354475 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.684e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 SCAF8-202ENST00000367186 4908 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DPM1-204ENST00000413082 672 ntTSL 310.75□□□□□ -0.698e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CORO1C-218ENST00000552030 547 ntTSL 510.66□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NAALADL1-211ENST00000529685 604 ntTSL 310.65□□□□□ -0.74e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 WDR91-202ENST00000423565 4500 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EHMT1-205ENST00000462942 7842 ntTSL 210.53□□□□□ -0.724e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CORO1C-212ENST00000549772 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-210ENST00000512605 3442 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.744e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 ANKRD13D-203ENST00000504186 564 ntTSL 410.22□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EHMT1-237ENST00000637261 4208 ntTSL 510.22□□□□□ -0.774e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FKBP1A-202ENST00000381719 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.794e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 GAK-212ENST00000510022 618 ntTSL 49.99□□□□□ -0.814e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DDB1-225ENST00000545930 1278 ntTSL 29.87□□□□□ -0.834e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DPM1-203ENST00000371588 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.838e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CORO1C-209ENST00000547361 683 ntTSL 29.76□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 RIC8B-205ENST00000470628 2134 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.854e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 WDR91-207ENST00000479698 683 ntTSL 39.62□□□□□ -0.874e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 WDR91-204ENST00000466182 3594 ntTSL 29.36□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 RBBP9-201ENST00000337227 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.934e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CLASP1-207ENST00000452274 3966 ntTSL 59.2□□□□□ -0.944e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-209ENST00000503133 1896 ntTSL 29.02□□□□□ -0.974e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 OSBPL2-207ENST00000618198 693 ntTSL 28.85□□□□□ -0.994e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 EHMT1-249ENST00000637949 575 ntTSL 58.83□□□□□ -14e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 TMEM222-209ENST00000498220 679 ntTSL 38.74□□□□□ -1.014e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CEP85-206ENST00000476272 3507 ntTSL 28.69□□□□□ -1.024e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 ACTG1P20-201ENST00000486001 468 ntBASIC8.43□□□□□ -1.064e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DDB1-208ENST00000537120 1215 ntTSL 28.39□□□□□ -1.074e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 SSFA2-215ENST00000495248 219 ntTSL 58.3□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.081e-8■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.114e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 BCLAF1-223ENST00000628517 2512 ntTSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.144e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 BCLAF1-210ENST00000529826 2423 ntTSL 57.89□□□□□ -1.152e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.154e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NIPSNAP2-206ENST00000456204 660 ntTSL 37.62□□□□□ -1.194e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 BCLAF1-216ENST00000532384 3237 ntTSL 57.57□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 SSFA2-206ENST00000440623 5420 ntTSL 27.55□□□□□ -1.24e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 DPM1-201ENST00000371582 1161 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.218e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CEP85-201ENST00000252992 3935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 COL4A5-205ENST00000483338 3622 ntTSL 1 (best)7.35□□□□□ -1.234e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FKBP1A-203ENST00000381724 976 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.254e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 AEBP2-206ENST00000538425 518 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.11□□□□□ -1.274e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-206ENST00000480659 866 ntTSL 46.68□□□□□ -1.344e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 INTS3-205ENST00000476843 3404 ntTSL 1 (best)6.57□□□□□ -1.364e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.38□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FKBP1A-206ENST00000460490 694 ntTSL 26.14□□□□□ -1.434e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 FKBP1A-208ENST00000474726 551 ntTSL 35.86□□□□□ -1.474e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.484e-7■■■■■ 38
RBM22Q9NW64 GAK-215ENST00000511229 568 ntTSL 35.71□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 38
Retrieved 100 of 21,863 protein–RNA pairs in 599.4 ms