Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FANCLQ9NW38 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FANCLQ9NW38 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FANCLQ9NW38 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCLQ9NW38 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FANCLQ9NW38 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.5 ms