Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC40.77■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
PDS5BQ9NTI5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC40.73■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC40.71■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PDS5BQ9NTI5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC40.67■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC40.65■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PDS5BQ9NTI5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
PDS5BQ9NTI5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms