Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE2

CISH, Cytokine-inducible SH2-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CISHQ9NSE2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CISHQ9NSE2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CISHQ9NSE2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CISHQ9NSE2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms