Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRY6

PLSCR3, Phospholipid scramblase 3, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLSCR3Q9NRY6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PLSCR3Q9NRY6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLSCR3Q9NRY6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLSCR3Q9NRY6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLSCR3Q9NRY6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms