Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP4

SDHAF3, Succinate dehydrogenase assembly factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF3Q9NRP4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SDHAF3Q9NRP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SDHAF3Q9NRP4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHAF3Q9NRP4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHAF3Q9NRP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHAF3Q9NRP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHAF3Q9NRP4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SDHAF3Q9NRP4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms