Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GDF3Q9NR23 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GDF3Q9NR23 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GDF3Q9NR23 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms