Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
INCENPQ9NQS7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
INCENPQ9NQS7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
INCENPQ9NQS7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms