Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFRSF12AQ9NP84 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFRSF12AQ9NP84 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFRSF12AQ9NP84 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms