Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VAT1LQ9HCJ6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
VAT1LQ9HCJ6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VAT1LQ9HCJ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms