Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC24

TMBIM4, Protein lifeguard 4, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMBIM4Q9HC24 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMBIM4Q9HC24 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMBIM4Q9HC24 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMBIM4Q9HC24 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms