Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
REEP1Q9H902 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
REEP1Q9H902 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
REEP1Q9H902 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.9 ms