Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SMOC1Q9H4F8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMOC1Q9H4F8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SMOC1Q9H4F8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms