Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00597Q9H2U6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00597Q9H2U6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LINC00597Q9H2U6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LINC00597Q9H2U6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms