Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SEMA6AQ9H2E6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SEMA6AQ9H2E6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEMA6AQ9H2E6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms