Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YIPF3Q9GZM5 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YIPF3Q9GZM5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.2 ms