Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TRIM4Q9C037 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM4Q9C037 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM4Q9C037 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms