Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TRIM5Q9C035 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRIM5Q9C035 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRIM5Q9C035 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms