Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM55Q9BYV6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM55Q9BYV6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms