Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CADM1Q9BY67 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CADM1Q9BY67 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM1Q9BY67 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM1Q9BY67 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM1Q9BY67 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CADM1Q9BY67 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms