Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TDRD1Q9BXT4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TDRD1Q9BXT4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TDRD1Q9BXT4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms