Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
C1orf50Q9BV19 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C1orf50Q9BV19 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms