Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPPED1Q9BRF8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPPED1Q9BRF8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPPED1Q9BRF8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms