Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PRRT1Q99946 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRRT1Q99946 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRRT1Q99946 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms