Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NAP1L3Q99457 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NAP1L3Q99457 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NAP1L3Q99457 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NAP1L3Q99457 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms