Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CSF3RQ99062 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CSF3RQ99062 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms