Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK5RAP2Q96SN8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK5RAP2Q96SN8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CDK5RAP2Q96SN8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms