Protein–RNA interactions for Protein: Q96QU6

ACCS, 1-aminocyclopropane-1-carboxylate synthase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACCSQ96QU6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACCSQ96QU6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACCSQ96QU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACCSQ96QU6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACCSQ96QU6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACCSQ96QU6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms