Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SMG1Q96Q15 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SMG1Q96Q15 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SMG1Q96Q15 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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