Protein–RNA interactions for Protein: Q96PN7

TRERF1, Transcriptional-regulating factor 1, humanhuman

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Length 1,200 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRERF1Q96PN7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRERF1Q96PN7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRERF1Q96PN7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRERF1Q96PN7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRERF1Q96PN7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRERF1Q96PN7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
TRERF1Q96PN7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRERF1Q96PN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRERF1Q96PN7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
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