Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AGAP4Q96P64 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
AGAP4Q96P64 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AGAP4Q96P64 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms