Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
YTHDC1Q96MU7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
YTHDC1Q96MU7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
YTHDC1Q96MU7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms