Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
GJD4Q96KN9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC31.2■■■□□ 2.59
GJD4Q96KN9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
GJD4Q96KN9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms