Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MS4A4AQ96JQ5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MS4A4AQ96JQ5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MS4A4AQ96JQ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms