Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNF8Q96H20 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SNF8Q96H20 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SNF8Q96H20 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms