Protein–RNA interactions for Protein: Q96GJ1

TRMT2B, tRNA (uracil(54)-C(5))-methyltransferase homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT2BQ96GJ1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRMT2BQ96GJ1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRMT2BQ96GJ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRMT2BQ96GJ1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRMT2BQ96GJ1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms