Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH5

RPL39L, 60S ribosomal protein L39-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39LQ96EH5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RPL39LQ96EH5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPL39LQ96EH5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms