Protein–RNA interactions for Protein: Q96DV4

MRPL38, 39S ribosomal protein L38, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL38Q96DV4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MRPL38Q96DV4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL38Q96DV4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MRPL38Q96DV4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL38Q96DV4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL38Q96DV4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL38Q96DV4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms