Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ROPN1LQ96C74 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ROPN1LQ96C74 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ROPN1LQ96C74 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms