Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM43Q96BQ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM43Q96BQ3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM43Q96BQ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM43Q96BQ3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms