Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLDN23Q96B33 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLDN23Q96B33 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLDN23Q96B33 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms