Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAMP4Q969E2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SCAMP4Q969E2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAMP4Q969E2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153 ms