Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
UBLCP1Q8WVY7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
UBLCP1Q8WVY7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms