Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVK7

SKA2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKA2Q8WVK7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SKA2Q8WVK7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SKA2Q8WVK7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SKA2Q8WVK7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms