Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TWIST2Q8WVJ9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TWIST2Q8WVJ9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TWIST2Q8WVJ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms