Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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C15orf40Q8WUR7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
C15orf40Q8WUR7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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C15orf40Q8WUR7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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C15orf40Q8WUR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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C15orf40Q8WUR7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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C15orf40Q8WUR7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
C15orf40Q8WUR7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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