Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF37

LPCAT1, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT1Q8NF37 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LPCAT1Q8NF37 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LPCAT1Q8NF37 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LPCAT1Q8NF37 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms