Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MCPH1Q8NEM0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCPH1Q8NEM0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCPH1Q8NEM0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms